在玩辐射避难所的时候你需要利用自己现有的资源去维持避难所的运行，想要让避难所运营下去是一件比较困难的事情。你不仅需要面对外界的影响，而且避难所内部也经常会出现问题，要想让避难所运营的更久你需要为避难所选择一个合理的布局。
在这个游戏中布局是非常重要的一个环节，一个好的布局可以让你的游戏变得更加轻松。避难所的布局最好在前期就规划好，越早布局你到后期优化起来的时候会越轻松。你在前期不考虑布局的话虽然不会影响什么，但是到了中后期影响就会变大，这个时候你要是再去考虑布局的问题就晚了，后期去变动布局的话需要耗费大量的材料，一个不小心就容易让你的避难所垮掉。在大门的右侧你需要建立好一片防御区，不管是强盗还是丧尸都会从大门进来然后往右边走，要是没有防御区的话损失会更大。第一个防御区你可以放在大门的右侧，并且让三个房间连在一起，也就是常说的三联。在三联的房间里面你可以放一个电梯，当有侵入者进入的时候它们会经过三联房间，你只需要在三联房间里面放一些战斗力高的队员就行。当敌人想要坐电梯前往下面一层的时候需要再次返回三联房，这个时候它们又会受到一次三联房的攻击，一般来说第二波大部分侵入者都会被消灭掉。在三联房的旁边你可以放一个水厂，这样三联房中的小人在抵抗外敌的时候会有更高的精准度。发电厂也是必不可少的，只有你的避难所中有电，你才能让避难所中的其它设施运行下去。
前期你可以多建造一些电梯，这样就可以方便自己往地下深处扩建，在第二层你可以在电梯两边各放置一个三格餐厅，这样小人们要吃饭的时候就会聚集到二楼，此时若有人来进攻避难所的话你可以迅速的召集战斗人员前往第一层战斗。在地下第三层的是你可以建造两个三联发电厂，拥有这么多电厂后你不需要担心自己没有电的问题。地下第四层可以建造水厂，建造两个三联水厂后你就不需要担心自己的避难所这个会没有水。建好这些基础设施后避难所就可以正常地运行，在这个时候你要是想要建造一些其它设施也是可以的，当你缺武器的时候你可以选择去建造武器库，你可以将它放在地下第五层，在它旁边可以放一个仓库用来存储东西。医务室和科学实验室可以建造在地下第六层，这两个建筑对于游戏的发展起着比较大的作用，医务室可以治疗小人的疾病，科学实验室能够让小人研发出高新技术，避难所拥有高新技术后运行起来会更加简单。科学实验室和医疗室都需要建造成三格，这样才够用，而且你还需要将这两个建筑往下面放，因为一旦这两个建筑出了问题就会给避难所带来非常大的影响。
